公务员晋升领导职务的程序主要包括以下几个步骤：
动议
党委（党组）或者组织（人事）部门在深化干部日常了解、加强综合分析研判基础上，提出启动干部选拔任用工作的意见并形成工作方案。
民主推荐
党委（党组）及其组织（人事）部门根据配备领导班子和选拔干部的需要，按照规定的程序、范围和要求，组织有关方面人员推荐领导干部人选。民主推荐包括谈话调研推荐和会议推荐，推荐结果作为选拔任用的重要参考，在1年内有效。
确定考察对象，组织考察
党委（党组）及其组织（人事）部门根据干部管理权限，按照规定的程序和方法，对确定的考察对象进行全面了解和公正评价，为干部的选拔任用等提供依据。考察工作要符合规定的实施主体、考察内容、程序与方法、考察谈话和征求意见的范围等要求。
讨论决定
按照管理权限讨论决定干部任免的主体、对象、程序、方式和要求等都有明确规定。讨论决定干部任免时，必须有三分之二以上的成员到会，并且要充分发表同意、不同意或缓议等明确意见。
公示
对拟晋升的干部进行任职前公示，公示期为5个工作日。在公示期内，没有人提出意见或其他违法乱纪事件，才可以上报上级单位备案审批。
任职
经过上述程序后，由上级组织部门正式任命，并办理相关的任职手续。
任职试用期
根据新的公务员法规定，公务员晋升领导职务后，需要实行任职试用期制度，试用期为一年。
这些程序确保了公务员晋升的公正性、透明性和合法性，通过综合运用多种方式，全面评估干部的德才表现和工作实绩，最终选拔出合适的干部担任领导职务。