行政案件转为刑事案件后，程序主要包括以下几个阶段：
案件立案
行政机关在初步调查后，如认为案件涉嫌刑事犯罪，应依法立案。
证据收集与性质认定
行政机关收集相关证据，并在收集到足够证据后对案件性质进行认定。如认为构成刑事犯罪，需将案件移交给公安机关。
案件侦查
公安机关接手案件后，进行深入侦查，搜集更多证据。
起诉与审判
侦查结束后，公安机关将案件起诉至人民法院。法院审理案件，根据证据和法律作出判决，并执行判决结果。
法院审判流程
审查起诉阶段：法院审查检察机关移送的起诉书及相关证据材料，判断案件是否符合起诉条件。
开庭审理：包括法庭调查、法庭辩论和被告人最后陈述等环节，以查明案件事实。
评议和宣判：庭审结束后，合议庭评议案件，根据事实、证据和法律作出判决，并公开宣判。
法律依据
行政转刑事案件的法律依据主要来源于《刑法》及其相关规定。
程序转换与协作
行政机关在查处行政案件过程中，发现涉嫌犯罪应及时移送至有管辖权的司法机关。移送时要将相关证据材料一并移送。
司法机关接到移送案件后，会进行审查，符合刑事立案条件的予以立案侦查，不符合的退回行政机关继续按行政案件处理。
在整个转换过程中，行政机关和司法机关之间要保持沟通与协作，确保案件处理连贯一致，实现刑事与行政程序的顺利转换。