医院编制离职程序如下：
提交个人辞职申请
提交《事业单位工作人员辞职申请表》，并且需要院系部处领导签字盖章。
报人事处提交请示
将辞职申请报人事处，并由医院主管领导审批，之后发文公布。
领取同意辞职文件
领取同意辞职的文件和离院通知单，然后办理离院手续。
办理社保视同缴纳证明
到综合科办理社保视同缴纳证明。
提交调档函
提交调档函，注明接收单位地址、邮编、接收人姓名及联系方式，人事处将个人档案寄出。
协商解除聘用合同
如果辞职原因不符合相关《事业单位聘用合同办法》规定的情形，需要与单位协商一致解除聘用合同。协商不成的，受聘人员应当继续履行合同，在一定期限后再次提出解除仍未能协商一致的，可以单方面解除合同。
履行其他相关手续
包括归还医院财物、结清工资、办理人事手续等。
等待审批和回复
提交辞职申请后，需要等待医院和相关主管部门的审批和回复，期间可能需要与多个部门协调和沟通。
完成所有离职手续
在所有辞职手续完成后，正式解除与医院的劳动合同，员工即可离职。
建议：
辞职过程可能较为复杂，建议提前规划并预留足够的时间办理各项手续。
与医院保持良好沟通，确保所有步骤按流程进行。
留意相关法规和政策，确保辞职过程合法合规。