农用仓库的审批程序主要包括以下几个步骤：
申请阶段
申请人需向当地村委会提出书面用地申请，并提交相关申请材料。
村委会应当在每一个季度集中申请材料，并依法召开村委会或村民代表大会进行审议，张榜公布。在张榜公布之日起15个工作日内，如本村村民未提出异议或者异议不成立，则上报给乡镇国土资源所初审。
现场勘查
乡（镇）人民政府组织国土资源所进行现场勘查和群众调查，审查建房用地和建设申请条件，并制作勘查笔录和审查意见书。
审核与审批
初步审核通过后，国土资源所发放《农村村民住宅用地与建设申请表》。
无异议后，将用地户按规定报乡镇人民政府审核，并报县人民政府审批。
办理规划许可证和施工许可证
到规划部门办理规划许可证和施工许可证。
设计规划
在取得相关资质和证件后，进行设计规划，并将设计方案提交规划部门审批。
其他部门审批
方案通过后，需报消防、卫生、建设部门审批。
领取相关批准文件
根据法律法规、环境污染、健康防护等规定，向政府相关部门进行报批，领取批准文件，如仓库设计图纸、建造许可证、规划地图等。
施工与验收
落实安全、消火、电气和其他生产设施等要求，进行施工报建。
建设完成后，需向当地农业部门申请验收，验收合格后，农业部门将为申请人颁发粮仓库房使用许可证。
备案
根据相关条文规定，建设农机库应当由本人申请、村委会同意、乡级人民政府审核、签订三方用地协议（个人、村委会、乡级人民政府）、设施建设方案和复垦方案公示、乡级人民政府申请设施农用地报告、国土资源局和农业委员会备案。
建议：
在申请过程中，确保所有材料的真实性和完整性，并按照规定的程序进行申请。
与当地政府部门保持良好沟通，及时跟进审批进度，确保项目顺利进行。