纪委立案后的程序主要包括以下几个步骤：
调查阶段
立案后，纪委将转入调查阶段，调查期限为3个月，必要时可延长1个月。重大或复杂案件在延长期内仍不能查结的，可报立案机关批准后延长调查时间。
调查阶段包括收集证据、查明违纪事实等，调查组会写出调查报告，并与涉案人员见面签字，对不同意见作出说明。
移送审理
调查结束后，纪委根据调查结果决定处罚违法违纪行为，并将案件移送审理部门进一步调查处理。
审理部门会对案件进行审核、审议，并写出审理报告。
处理决定与执行
审理结束后，纪委监委将根据案件的性质和情节，依法依规作出处理决定。处理决定会公正、合法、及时，确保案件得到妥善处理。
对于涉嫌犯罪的问题，纪委监委会及时移送司法机关处理。
批准与执行
处理决定需要经过纪委监委主要负责人签字审批，并报同级党委“一把手”批准。
处分决定送达本人和相关单位，处分执行情况需回执。
立卷归档
案件处理完毕后，所有相关文件和材料需立卷归档，确保案件处理的完整性和可追溯性。
这些程序确保了案件处理的公正、透明和合法，保障了被调查对象的合法权益。建议在实际操作中，纪委应严格按照上述程序执行，确保每一个环节都符合法律法规的要求。