外贸清关运输程序通常包括以下几个主要步骤：
货物抵达
进出口货物抵达港口或机场后，需先进行卸货、分拣等操作，然后等待海关的监管和检查。
海关查验
海关可能根据需要对货物进行查验，查验内容包括但不限于货物的数量、质量、包装、标识等。如货物需进行特殊检验（如放射性检验、动植物检疫等），还需经过相关部门的检验。
缴纳税费
在清关过程中，企业需根据海关的要求缴纳相关税费，包括但不限于关税、增值税、消费税等。
换单
去货代或船公司换签提货单（D/O）。这个过程需要根据手中的提单类型（如HB/L货代提单或MB/L船东提单）来决定具体的换单地点。
电子申报
使用电脑系统录入并发送报关内容至海关南单系统，同时等待海关审核。
办理商检手续
对于一些特殊商品，比如化妆品或食品，还需要额外的许可文件，例如进口批文、标签备案等。
缴纳关税和税款
根据货物的性质和价值，海关会依法征收关税、增值税等税费，企业需要按照规定缴纳并在规定时间内获得缴费凭证。
清关后处理
领取清关文件，保存合法进出口证明。处理退税（如符合条件），并完成最终交付，确保货物安全送达。
注意事项与常见问题
在外贸清关过程中，企业需要注意遵守各国法律法规，确保所有文件的真实性和完整性，避免因违规而导致的法律责任和处罚。
以上步骤是外贸清关运输程序的概述，具体情况可能会因国家、货物类型、贸易条款等因素有所不同。建议企业在进行外贸活动时，提前了解并遵守目的地国家的清关规定，以确保清关过程顺利进行。