因公殉职的认定程序主要包括以下几个步骤：
事故伤害发生后
单位主管及同事应协助受伤害员工在第一时间内送往社会保险定点医院救治，伤情危急的可先送就近医院抢救。
单位主管需提出报告
详细叙述事故发生经过，包括时间、地点、人物、事情等，并送人事单位留存。
人事单位提出工伤认定申请
附上相关数据向社保部门书面提出工伤认定申请，并依规定申请医疗补助。
工伤认定申请
需要单位主管和受伤员工配合提供相关证据和材料。
劳动能力鉴定
进行劳动能力鉴定，劳动能力鉴定结论于七个工作日（不包括假期）到社保局领取。
认定批准
认定流程一般需要县级以上单位的组织或人事部门批准和县、市、市辖区民政部门审核同意。
综上所述，因公殉职的认定流程包括伤员救治、工伤申请、劳动能力鉴定及烈士批准，由县级以上单位完成组织或人事部门的批准和民政部门的审核同意。