卖自建房需要遵循以下程序：
签订书面买卖合同
买卖双方需签订书面的房屋买卖合同，明确双方的权利义务关系，包括房屋的基本情况、价格、付款方式、交房时间等重要条款。
办理宅基地使用权及房屋所有权的变更登记手续
按照当地的规定，办理宅基地使用权及房屋所有权的变更登记手续，通常需要经过村集体同意，到当地的乡镇土地管理部门等相关机构进行备案登记。
缴纳相关税费
卖方需要缴纳个人所得税和印花税、契税等税费。具体税费标准可能因地区而异，建议咨询当地税务部门获取详细信息。
提交必要的申请材料
提交户口簿、居民身份证、土地证、房产证等相关材料的原件，并确保所有文件符合当地政府的具体要求。
办理房屋转让登记
买卖双方需携带身份证明、房权证、买卖合同、村委证明、过户确权审批表等材料到房管部门办理网签和登记手续。
经过村委会同意
农村自建房买卖需经集体即村民委员会书面同意，如系共有房屋，必须征得其他共有人同意。
核查产权
到产权登记部门查看房屋产权是否存在瑕疵，是否存在抵押等担保、是否有人民法院采取查封等财产保全措施。
缴纳税金
房产过户的申请材料都交给房产局后，房产局会给予一个回执单，按照回执单上面说明的日期去缴纳税金，一般需要十五个工作日左右。
领取房产证
税金缴纳完毕后便可拿到房产证，买卖双方进行交接，过户完毕。
建议：
在整个过程中，建议咨询当地相关部门或专业律师，确保所有手续和税费符合法律法规要求，避免后期纠纷。