申请离职补偿的程序如下：
协商
劳动者首先可以尝试与用人单位进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。
收集证据
劳动者应收集并整理好所有相关证据，如工作记录、工资条、劳动合同等，以证明其已履行劳动义务及用人单位的拖欠工资行为。
申请调解
如果协商未能达成一致，劳动者可以向当地的劳动争议调解组织申请调解。
申请劳动仲裁
调解不成或用人单位拒绝履行调解协议的，劳动者可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。在申请劳动仲裁前，劳动者应确保已收集并整理好所有能证明其已履行劳动义务及用人单位拖欠工资的证据。
提起诉讼
如果对劳动仲裁裁决不服，劳动者还可以向人民法院提起诉讼。
注意时效和流程
劳动者在离职时应办理工作交接等手续，若用人单位拒不支付经济补偿，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。未依法为劳动者缴纳社会保险费等情形下，劳动者有权要求经济补偿。
在整个流程中，劳动者应始终保持冷静和理性，依法维护自己的合法权益，并可以寻求专业法律人士的帮助，以确保自己的权益得到充分保障。