股权冻结拍卖的程序主要包括以下几个步骤：
股权冻结与调查
向股份企业和工商行政管理部门调查了解被执行人的股权情况和股份企业的有关情况。
裁定冻结被执行人的股权，并通知股份企业对被执行股东的股权限期先作为内部转让处理，如其他股东优先购买、指定受让人等。
评估与公告
委托有关部门对股权进行评估作价。评估时，法院可以责令有关企业提供会计报表等资料，有关企业拒不提供的，可以强制提取。
发布强制转让、拍卖、变卖公告。公告应当包括拍卖股权的基本信息、保留价、竞拍时间等。
拍卖与成交
选择拍卖机构，处理拍卖中的特殊问题，如股权权属、保留价、保证金等。
进行公开竞拍。竞拍者报名并缴纳保证金，竞拍过程公开进行。
拍卖成交后，办理股权过户。未实缴股权的买受人需继续履行出资义务。
结束与后续
拍卖结束后，如果拍卖成交，买受人需支付价款并办理股权过户手续。如果流拍，可以按照相关法律规定进行后续处理。
整个程序需严格遵循相关法律规定，确保拍卖过程的公正、透明和合法性。建议申请执行人和被执行人在整个过程中积极配合法院和拍卖机构，确保股权拍卖的顺利进行。