在日本预订酒店，可以使用以下几种程序：
JTB（日本交通公社）
JTB是日本最大的旅行公司之一，提供酒店预订服务。您可以通过JTB的官方网站或移动应用程序进行预订，出示护照并告知预定号即可。
Jalan.net
Jalan.net是由Recruit提供的日本最大的酒店和酒店预订网站。您可以通过其官方应用程序或网站搜索和预订日本境内的酒店、民宿和温泉等。
携程旅行
携程旅行是一款全球性的酒店预订平台，提供包括日本在内的全球上万家酒店的预订服务。您可以通过携程旅行App或网站，根据您的需求快速找到并预订合适的酒店。
Skyscanner天巡旅行
Skyscanner天巡旅行是一个全球性的旅行比价平台，您可以通过它找到并预订日本各地的酒店，包括豪华酒店和特色民宿。
Booking.com
Booking.com是一个全球知名的酒店预订平台，提供包括日本在内的各种住宿选择。您可以通过其网站或移动应用程序进行预订，并且可以查看其他用户的评价和评分。
Agoda
Agoda是另一个全球性的酒店预订平台，提供包括日本在内的广泛住宿选择。您可以通过其网站或移动应用程序进行预订，并且经常有优惠活动。
乐天旅行
乐天旅行是日本的一个大型旅行网站，提供酒店、机票、火车票等预订服务。您可以通过其网站或移动应用程序进行预订，但需要注册会员。
第三方平台
除了上述平台外，您还可以通过一些第三方平台如飞猪、安歌达等进行酒店预订，这些平台通常提供比价服务，方便您找到最优惠的住宿选项。
建议
初次赴日：建议使用国内各大OTA平台（如携程、去哪儿、Skyscanner等）进行比价和预订，这些平台提供的服务比较全面，且通常有24小时客服支持，能够解决出行前和出行中的问题。
深度游：如果您会日语且追求更深度的旅游体验，可以尝试使用日系的OTA平台，如乐天旅行，这些平台可能提供更多本地化的服务和优惠活动。
会员体系：考虑注册一些平台的会员，以享受会员专属的折扣和优惠，长期出国游的朋友尤其推荐使用。