增值税发票的认证方式主要有以下几种：
远程认证
纳税人自行扫描、识别专用发票抵扣联票面信息，通过网络传输至税务机关进行解密和认证，认证结果信息会返回给纳税人。
上门认证
纳税人需要携带增值税专用发票抵扣联等资料，到税务机关的申报征收窗口或自助办税机进行认证。
勾选认证
纳税人通过特定网址查询升级版增值税开票系统开具给自己的增值税发票信息，通过勾选和确认的形式完成发票认证。
网上认证
纳税人登录当地增值税发票综合服务平台，插入税控器具并输入密码，选择认证税款所属期，进行发票抵扣勾选、查询、提交等操作来完成认证。
金税盘认证
插上金税盘在电脑上，登录增值税发票选择确认平台，输入税控盘证书密码，进行发票勾选、保存、确认等操作来完成认证。
建议：
纳税人应根据自身情况选择最便捷的认证方式，如经常使用网上认证系统的纳税人，可以选择网上认证以节省时间和精力。
对于不熟悉网络操作的纳税人，可以优先考虑上门认证或远程认证，由税务人员提供辅助。
勾选认证适合有大量发票需要认证的情况，可以批量处理，提高效率。