民间非营利组织会计制度下的会计科目分为以下几大类：
资产类
现金
银行存款
其他货币资金
短期投资
应收票据
应收账款
其他应收款
预付款项
存货
长期股权投资
长期债权投资
固定资产
无形资产
长期待摊费用
投资
负债类
应付款项
预收款项
长期负债
递延收益
短期借款
应付工资
应交税金
所有者权益类
捐赠收入
基金
专项资金
净资产
成本类
直接成本
间接成本
损益类
收入
支出
捐赠支出
管理费用
财务费用
资产减值损失
其他类
捐赠物资
折旧
摊销
减值准备
此外，根据民间非营利组织的具体情况，可以在不违背会计科目使用原则的基础上，自行增设、减少或合并某些会计科目。明细科目的设置，除本制度已有规定外，也可以根据需要进行自行确定。
这些会计科目为民间非营利组织提供了详细的核算框架，有助于其准确反映财务状况和运营成果，满足对外提供统一财务会计报告的要求。