当您的快递在菜鸟驿站丢失时，您可以按照以下步骤进行赔偿：
确认丢失情况
首先，您需要确认快递是否确实丢失。如果只是延误或损坏，可以根据快递公司的规定进行索赔。
检查快递单据
准备好快递单据，包括快递单号、邮寄凭证等，以便在索赔过程中提供。
联系菜鸟驿站
您可以直接联系负责您快递的菜鸟驿站，说明情况并进行投诉。如果驿站工作人员未能解决问题，您可以要求升级到上级管理部门。
拨打官方客服电话
如果通过驿站无法解决问题，您可以拨打菜鸟驿站的官方客服电话【9519666】，向客服人员详细说明情况并进行投诉。
提交申诉
如果电话投诉未能解决问题，您可以通过邮政业申诉服务平台提交申诉。申诉平台网址为：https://sswz.spb.gov.cn/。在平台上登录账号，填写投诉信息，邮政总局工作人员会进行核查并组织双方调解。
法律途径
如果以上途径均未能解决问题，您可以选择通过法律手段维护自己的权益，直接向本地人民法院提起诉讼，要求菜鸟驿站赔偿损失。
赔偿方式
未保价快递：
未实行保价措施的情况下，快递公司会依照提供服务所收取的费用（不包含任何额外费用）乘以2倍的方式进行赔偿。对于包裹物品类型的快件，会根据实际损失价值进行补偿，但最高赔偿数额不得超过服务费用的5倍。
已保价快递：
对于已实施保价措施的快件，快递公司会按照保价金额的2%来收取保价费用。一旦快件发生遗失，将依据保价金额进行全额赔偿，保价最高限额为每单人民币壹万元整。
注意事项
在收到货物时，务必检查货物是否完好无损，避免因未及时检查而影响索赔。
如果快递在运输过程中因不可抗力（如自然灾害、空难等）导致延误或损毁，快递公司通常不承担责任。
建议您在邮寄重要文件或贵重物品时，选择保价服务，以便在发生丢失时能够获得更充分的赔偿。
希望以上信息能帮助您顺利解决快递丢失的赔偿问题。