船厂办理环保程序的步骤如下：
立项备案
确定企业或工厂所占用的土地性质，是否为工业用地。如果是非工业用地，则需要进行搬迁。
前往当地政务中心项目备案窗口，完成企业环保项目的备案工作。
环评编制及审批
备案通过后，寻找专业的第三方环评服务机构，提供环评报告的编制和送审工作。
环评机构来人查看现场，企业提供环评中所需的一切资料及细节。
环评机构根据项目所用设备、原材辅料，编制开工建设前对项目所在地周边空气环境检测的具体内容，并出具检测报告。
环评机构编制环评报告，并提交审批。
建设安装
在建设安装过程中，企业需要按照环评要求安装相应的环保设施，如废气、废水处理设施等。
排污许可证办理
在试生产或试运行之前，企业必须取得排污许可证。申请排污许可证时，需要提交环评报告的批复文件。
试生产及验收
企业在试生产阶段需进行实际排污行为，因此必须持证排污。
完成试生产后，企业需要进行环保验收。验收合格后，企业方可正式投产。
应急预案编制及备案
企业需要编制突发环境应急预案，并在每年10月份前将应急预案备案至地方主管环保局。
台账记录及检测
在排污许可证规定的期限内，企业需要记录相关台账并进行定期检测，确保排污符合环保要求。
以上步骤仅供参考，具体办理流程和所需材料可能因地区和行业而异，建议咨询当地环保部门或专业环评机构获取详细信息。