党组分工确定程序一般包括以下几个步骤：
主要负责人酝酿基本思路
单位的正职领导（俗称一把手）会先酝酿出基本的分工思路。
正职与副职沟通
正职领导会分别与副职领导进行谈话，交流沟通想法，以进一步明确分工安排。
人事部门形成方案
单位的人事部门会根据主任的思路，制定出具体的分工方案，并将方案提交给委党组会讨论。
党组会讨论通过
委党组会将对分工方案进行讨论，并通过正式文件印发确定分工。
会议集体研究确定
领导班子分工一般由单位主要负责人（一把手）负责，单位的正副职领导组成领导班子，确定领导分工时，一般应由班子会议集体研究确定。正职一般主持单位全面工作，副职的分工按单位三定方案确定的职能分别负责一块业务工作。会前，正职一般会就分工征求副职的意见尽量取得一致，然后会议通过发文件。
总结起来，党组分工确定程序是一个由主要负责人先提出基本思路，通过与副职的沟通和人事部门的协助，最终由党组会讨论通过并正式确定的过程。