企业开除员工的合法程序通常包括以下几个步骤：
明确解除理由
企业需根据《劳动合同法》等相关规定，明确解除劳动合同的理由，例如员工严重违反规章制度、不能胜任工作、严重失职等。
收集支持决定的相关证据，例如《规章制度签收确认函》、《员工处罚通知书》、《培训记录表》等。
通知工会
若企业设有工会，应在作出开除决定前将理由通知工会。工会有权提出意见或建议，企业应认真考虑。
书面通知员工
在确定解除理由并征得工会同意（如有）后，企业应向员工发出单方解除劳动合同的书面通知书。该通知书内容必须准确、完整、合法。
办理离职手续
包括工作交接、工具设备交还、档案和社会保险关系转移等。
结算工资
办理离职手续时，应结算员工的工资和其他未了事宜。
出具解除劳动合同的证明
用人单位在解除劳动合同时，应出具解除劳动合同的证明，并在规定时间内为员工办理档案和社会保险关系转移手续。
履行其他相关程序
如员工旷工导致开除，则无需支付经济补偿金。
用人单位单方解除劳动合同应事先将理由通知工会，并将决定公示或告知员工。
这些步骤旨在确保企业开除员工的过程合法、合规，并保护员工的合法权益。企业应严格按照相关法律和内部规章制度执行，以避免潜在的法律纠纷。