选择公司网站运行的程序时，可以考虑以下几种：
WordPress
特点：WordPress是一个功能强大的内容管理系统（CMS），适用于各种类型的网站，包括企业网站。它拥有大量的主题和插件，可以轻松实现网站的个性化定制。同时，WordPress的社区活跃，更新频繁，安全性较高。
Joomla
特点：Joomla是一个免费且开源的内容管理系统，适合中大型企业建站。它提供了丰富的功能和高度的可定制性，但相比WordPress，Joomla的学习曲线较陡峭。
Drupal
特点：Drupal是一个功能丰富的内容管理框架，适合开发复杂的企业网站。它的安全性和性能都非常出色，但Drupal的操作相对复杂，对开发人员的技术要求较高。
PHP
特点：PHP是一种通用开源脚本语言，常用于网站开发。它通常连接MySQL数据库，也能和Access、SQL Server等其他数据库连接。PHP因为开源框架多，资源广泛，很多公司企业的网站站点都是运用PHP设计制作的。
ASP.NET
特点：ASP.NET是微软公司开发的一个基于.NET平台的网站开发框架，使用C、VB.NET等语言进行开发。它具备开发网站应用程序的一切解决方案，包括验证、缓存、状态管理、调试和部署等全部功能。
ASP
特点：ASP是一种脚本编程技术，使用JavaScript或VBScript编写。它适合小型页面应用程序，但由于安全性问题，现在已经较少使用。
JSP
特点：JSP（JavaServer Pages）是一种动态网页技术标准，使用Java编程语言编写。它适合处理复杂的业务需求，但整体来说不太适合做网站，更多用于桌面软件。
建议
对于中小企业：如果网站功能相对简单，主要用于产品展示和企业形象宣传，可以选择WordPress或PHP。WordPress易于上手，有大量的主题和插件支持，而PHP则因为开源和安全性较好，也是不错的选择。
对于中大型企业：如果网站需要更多的功能和高度的可定制性，可以考虑Joomla或Drupal。这两个系统虽然学习曲线较陡峭，但功能强大，适合复杂的企业应用。
对于电商企业：Shopify是一个值得考虑的选项，它提供了一站式的电商解决方案，拥有丰富的电商功能和模板，适合快速搭建在线商店。
最终选择哪种程序还需根据企业的实际需求和情况来决定，包括网站的功能需求、预算、技术团队的能力等因素。