工程串标的程序通常涉及以下几个步骤：
串通行为
投标单位之间或投标单位与招标单位相互串通，目的是骗取中标。
招标人在开标前开启投标文件，并将投标情况告知其他投标人，或者协助投标人撤换投标文件，更改报价。
招标人向投标人泄露标底，或商定在投标过程中压低或抬高标价，中标后再给投标人或招标者额外补偿。
招标人预先内定中标人，或为某一特定的投标者量身定做招标文件，排斥其他投标者。
投标者之间窜通，内定最低价中标方，属“围标”。
法律后果
投标人相互串通投标或者与招标人串通投标的，中标无效。
处中标项目金额千分之五以上千分之十以下的罚款，对单位直接负责的主管人员和其他直接责任人员处单位罚款数额百分之五以上百分之十以下的罚款。
情节严重的，取消其一年至二年内参加依法必须进行招标的项目的投标资格并予以公告，直至由工商行政管理机关吊销营业执照。
构成犯罪的，依法追究刑事责任。
审计与发现
审计方法包括检查中标人的银行账和现金日记账，对照银行对账单，关注是否存在将同一整数金额分别转入两个或两个以上其他同类性质的企业账户之后，该笔资金又从转入企业转回的情况。
检查现金存取是否存在规律性的异常。
对竣工或在建的投资项目，关注中标人与其他投标人之间是否存在资金往来、合同关系。
审查投标文件，比对不同投标人的投标文件商务标报价差异是否呈一定的规律，商务标是否由同一人编制等。
处理程序
招标机构有权对涉嫌串标的投标文件进行初步分析，包括对投标文件内容的仔细对比、投标方相关资质及运营状况的深入了解等，从而初步判断是否确实存在潜在的串标问题。
如果经过初步调查后，发现确有串标嫌疑，招标机构将进一步展开更为详尽的调查取证工作。
一旦确认投标方确实存在串通作弊行为且违反了招标规则，招标机构有权立即取消其投标资格，同时将该投标方从招标范围内予以剔除。
这些步骤和措施旨在确保招标投标过程的公正、公平和透明，防止和打击串标等不正当行为。