转型项目认定程序通常包括以下几个步骤：
企业自我评价
企业对照转型项目的认定标准进行自我评价。
如果企业认为自身符合认定条件，则可以向相关发展改革委或服务业主管部门提出认定申请，并填报和提交申请材料。
提交申请材料
申请材料通常包括申请表、转型项目描述、转型措施、转型实施计划等，需详细说明企业符合认定标准的具体方面。
注册并在线申请
企业需要在上海科技网或上海科技成果转化网进行注册，并进入在线受理栏目。
在在线填写“上海市高新技术成果转化项目认定申请书”。
分级多路申请和初审
项目认定采取分级多路申请和初审的方式，即由多个受理点分别接收申请并进行初步审查，最终统一归口进行审定。
统一归口审定
经过初审后，所有申请将统一归口至相关主管部门进行最终审定，确定是否认定为转型项目。
建议企业在进行转型项目认定前，仔细阅读相关认定标准和申请要求，并进行充分的自我评估，以确保申请材料的准确性和完整性。