基金清算程序主要包括以下几个步骤：
启动清算程序：
当基金出现法定或约定的破产事由时，如资产严重亏损导致无法持续经营等情况，基金管理人会启动破产清算程序。基金管理人要成立清算小组，清算小组成员一般由基金管理人、托管人等相关人员组成。
资产清查和评估：
清算小组会对基金的资产进行全面清查，包括股票、债券、现金等各类资产，确定其准确的价值。同时，也要梳理基金的负债情况，如应付管理费、托管费等债务。
债务清偿：
在确定资产和负债后，按照法定的顺序进行清偿。一般先支付清算费用，包括清算小组的报酬等；其次偿还基金所欠的债务，如应付给托管人的托管费等。在清偿债务后，还需支付职工工资、社会保险费用和法定补偿金等。
剩余财产分配：
在清偿完所有债务后，将剩余的基金财产按照基金份额持有人持有的份额比例进行分配。
制作清算报告：
清算小组需制作清算报告，详细记录清算过程与结果。
备案与注销：
向中基协办理清算开始备案并向地方金融主管部门报备，通知全体投资人，办理税务清税和工商注销登记及银行账户注销手续。
信息披露与沟通：
将清算结果通过适当渠道向投资者及相关方进行信息披露，确保透明度。与投资者进行沟通，解答其对清算结果的疑问，确保信息的有效传递。
档案整理与流程评估：
对清算过程中产生的所有文件与数据进行整理，建立清算档案。对清算流程进行评估，分析存在的问题与不足，提出改进建议。
终结程序：
当破产清算程序全部完成，债务得到清偿，管理人向法院申请终结破产清算程序。法院审查后作出裁定，宣告基金破产清算程序终结。
在整个清算过程中，清算小组需接受监管部门的监督，以确保程序合法、公正、透明。基金管理人需要定期向监管部门和基金份额持有人报告清算进展情况。