部队集合整队的程序通常包括以下步骤：
听到口令后跑步到指定位置
听到“集合”的口令后，受训人员应迅速跑步到指定位置，并面向指挥员集合。在指挥员后侧的人员应从指挥员右侧绕过进入队列，自行对正、看齐，成立正姿势。
整队
人员到位后，指挥员会进行整队。首先，指挥员会下达“向右看齐”的口令，听到这个口令后，基准兵保持不动，其他受训人员迅速向右转头，眼睛看右邻受训人员的腮部。前四名应能通视基准兵，从第五名起，以能通视到本人以右第三人为度。后列人员先对正，再向右看齐。然后，指挥员会下达“向前看”的口令，所有人应迅速将头转向前方。
报数
接下来，指挥员会下达“报数”的口令。横队从右至左（纵队从前至后）依次以短促洪亮的声音转头报数，最后一名不转头。报数时，应确保声音清晰、响亮。
整理着装
指挥员会下达“整理着装”的口令，此时受训人员应整理自己的着装，确保整洁、得体。整理着装通常在立正的基础上进行，两手从帽子开始，自上而下将着装整理好。整理完毕后，自行稍息。
恢复立正姿势
整理着装完成后，指挥员会下达“停”的口令，受训人员随即恢复成立正姿势，准备进行下一项训练或任务。
敬礼与报告
最后，在需要的情况下，指挥员会转向职务最高人员或主持考核训练的领导，并在距离三至五步时敬礼。敬礼完毕后，指挥员会报告集合完毕的人数和情况，等待领导的指示。
以上步骤是部队集合整队的基本程序，具体实施时可能会有所调整，但总体流程是相似的。