在新疆办理离婚程序主要分为两种方式：协议离婚和诉讼离婚。
协议离婚
申请：
双方当事人共同到一方当事人常住户口所在地的婚姻登记机关提出申请。
提交材料：
需提交本人的户口簿、身份证、结婚证以及双方当事人共同签署的离婚协议书等材料。
审查：
婚姻登记机关对提交的材料进行审查，对符合离婚条件的，予以登记。
冷静期：
自婚姻登记机关收到离婚登记申请之日起三十日内，任何一方不愿意离婚的，可以向婚姻登记机关撤回离婚登记申请。
发证：
冷静期届满后三十日内，双方当事人应当亲自到婚姻登记机关申请发给离婚证；未申请的，视为撤回离婚登记申请。婚姻登记机关查明双方确实是自愿离婚，并已经对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的，予以登记，发给离婚证。
诉讼离婚
起诉：
一方要求离婚的，可以向法院提起诉讼。起诉时需提交起诉状、身份证、结婚证等相关材料。
法院审理：
法院会根据具体情况进行审理和判决。首先，法院会进行调解，如果调解不成会开庭审理，并作出判决。
提交申请：
向有管辖权的法院提交离婚诉讼申请，并缴纳诉讼费用。
法院调解：
法院会进行调解，调解过程中双方可自行协商离婚相关事宜。
开庭审理：
如果调解不成，法院将安排开庭审理，双方需按时出庭参与诉讼。
判决生效：
法院根据审理情况作出判决，如双方均未上诉，判决生效后婚姻关系解除。
执行判决：
判决生效后，一方需协助另一方办理相关手续，如房产过户等。
建议
协议离婚：双方自愿离婚且对子女抚养、财产及债务处理等事项协商一致的，建议选择协议离婚，流程相对简便且费用较低。
诉讼离婚：若一方不同意离婚或双方无法达成一致意见，建议通过诉讼解决，虽然程序较为复杂，但法院可以做出具有法律效力的判决。
建议在办理离婚手续时，先咨询当地婚姻登记机关或法院，了解具体流程和所需材料，以确保顺利完成离婚程序。