企业扣税步骤主要包括以下几个方面：
确定税务登记
公司需要根据所在地的税务要求完成税务登记，获取纳税人识别号或税务登记证明。
计算应纳税额
根据税法规定，计算所得税的应纳税额，这通常涉及计算公司的应纳税所得额和适用的税率。对于员工工资，扣税计算公式为：应纳税额 = （工资薪金所得 - “五险一金” - 个税起征点） × 适用税率 - 速算扣除数。
申报纳税
公司需按照规定的时间表提交纳税申报表。一般纳税人每月15日前申报增值税，每季度末下月的15日前申报所得税。
缴纳税款
将计算出的应纳税额按期纳入国库。
其他税务事项
包括增值税、消费税、营业税、城建税、教育费附加、地方教育费附加、印花税等。
内部管理和记录
建立内部发票管理制度，确保办税人员按照规定购买和使用发票。保留相关支出证明资料，如合同协议、银行打款记录、事故证明、收款证明等，以证明与企业取得收入有关。
税务发票
企业在销售商品或提供服务时需要开具税务发票，并在缴税时提供。
网上申报纳税
纳税人可以向国税局的征管部门提出网上申报纳税申请，经县（市）区局审批同意后，正式参与网上申报纳税。纳税人需要向税务机关提供在银行已经开设的缴税账户，并保证账户中有足够用于缴税的资金。纳税人与银行签署委托划款协议，委托银行划缴税款。利用计算机和申报纳税软件制作纳税申报表，并通过电话网、因特网传送给税务机关的计算机系统。税务机关将纳税人的应划缴税款信息，通过网络发送给有关的银行。由银行从纳税人的存款账户上划缴税款，并打印税收转帐专用完税证。银行将实际划缴的税款信息利用网络传送给税务机关的计算机系统。税务机关接收纳税人的申报信息和税款划缴信息，打印税收汇总缴款书，办理税款的入库手续。纳税人在方便的时候到银行营业网点领取税收转帐完税证，进行会计核算。
这些步骤确保了企业能够依法纳税，并且能够及时、准确地完成税务申报和缴纳工作。建议企业定期更新税务信息，确保符合最新的税收政策和规定，以减少税务风险。