伤害案件调查程序主要包括以下几个步骤：
受理案件
公安机关接到伤害案件报警或报案后，应当立即组织警力赶赴现场，制止伤害行为，组织救治伤员，并了解案件发生经过和伤情。
现场勘验与检查
现场具备勘验、检查条件的，公安机关应当及时进行勘验、检查，发现、固定、提取与伤害行为有关的痕迹、物证及其他信息，确定伤害状态，分析伤害过程，为查处伤害案件提供线索和证据。
调查取证
公安机关应当采取措施控制、追查嫌疑人，及时登记在场人员姓名、单位、住址和联系方式，询问当事人和访问现场目击证人，保护现场，收集、固定证据。
法医学损伤鉴定
对被害人进行法医学损伤鉴定，如果对鉴定结果有疑义可以重新鉴定。
讯问犯罪嫌疑人
讯问犯罪嫌疑人（如果到案的话）并对其采取强制措施（一般是取保候审或刑事拘留），之后是报捕、批捕后移诉。
案件处理
公安机关在立案之后进行调查取证，对案件进行处理，包括现场勘察、询问相关证人、对被害人进行法医学损伤鉴定、讯问犯罪嫌疑人等。
移送检察机关
公安部门侦查结束后向检察院申请批捕，检察院对案件的事实进行复核，复核后认为符合批捕条件的，向公安部门发放《逮捕证》，公安部门随即正式逮捕犯罪嫌疑人。
提起公诉
公安部门逮捕犯罪嫌疑人后，先将其羁押在看守所内，检察院择日向人民法院刑事审判庭提起公诉。
法院审判
人民法院刑事审判庭经过开庭、法庭调查、举证质证、法庭辩论、当事人做最后陈述、合议庭讨论定罪量刑意见后由审判长宣判。
以上是伤害案件调查程序的主要步骤，具体操作中可能会根据实际情况有所调整。建议在实际操作中参考相关法律法规和规范性文件，确保案件处理的合法性和有效性。