起诉公司的程序主要分为两种情况：
劳动仲裁
适用情况：适用于劳动争议，例如工资拖欠、违法解除劳动合同等。
程序：
向当地劳动争议仲裁委员会提交仲裁申请。
仲裁委会安排调解，调解不成则进入仲裁程序。
仲裁裁决后，如果员工或公司对裁决结果不服，可在规定期限内向法院提起诉讼。
民事诉讼
适用情况：适用于非劳动争议，例如公司侵犯员工的知识产权、名誉权等。
程序：
向有管辖权的人民法院提交起诉状和相关证据材料。
法院在立案后五日内将起诉状副本发送给被告。
被告在收到起诉状副本后十五日内提出答辩状。
法院安排开庭审理，双方进行举证、质证和辩论。
法院依法作出判决。
建议
收集证据：在提起诉讼前，务必收集和整理好所有相关证据，包括劳动合同、工资条、考勤记录、工作证明等。
咨询律师：在正式提起诉讼前，建议咨询专业律师，以获取更详细的法律建议和帮助。
注意时效：在诉讼过程中，要注意各项期限，确保在规定的时间内完成各项程序，以免丧失权利。
通过以上步骤，可以有效地维护自己的合法权益。