基层法院适用的程序主要有以下几种：
简易程序
适用条件：事实清楚、权利义务关系明确、争议不大的简单民事案件。此外，对于标的额在一定比例以下的简单金钱给付民事案件，也可以适用小额诉讼程序，实行一审终审。
适用范围：仅适用于基层法院及其派出法庭的第一审民事案件。
启动方式：可以基于职权启动，也可以基于当事人的约定启动，但当事人之间的相反约定无效。
普通程序
适用条件：除简易程序适用的案件外，其他民事案件均适用普通程序。
适用范围：适用于基层法院审理的所有第一审民事案件。
小额诉讼程序
适用条件：事实清楚、权利义务关系明确、争议不大的简单金钱给付民事案件，且标的额在各省、自治区、直辖市上年度就业人员年平均工资的百分之五十以下。对于标的额在这个比例以上但在二倍以下的案件，如果当事人双方同意，也可以适用小额诉讼程序。
适用范围：仅适用于基层法院及其派出法庭的第一审民事案件。
特别程序、审判监督程序、督促程序、公示催告程序和企业法人破产或还债程序
这些程序有特定的适用范围，不适用于简易程序。
建议
在选择适用程序时，法院应首先判断案件是否符合简易程序的适用条件，即事实清楚、权利义务关系明确、争议不大。
对于符合简易程序条件的案件，法院应优先考虑适用简易程序，以简化诉讼流程，提高审判效率。
对于不符合简易程序条件的案件，法院应根据案件的具体情况选择适用普通程序或小额诉讼程序。
当事人可以通过协商一致，约定适用简易程序，但法院需审查同意，且不得违反当事人自愿原则将普通程序转为简易程序。