员工造成公司损失时，赔偿责任的确定需综合考虑多个因素，包括员工的过错程度、损失原因、劳动合同约定、公司规章制度等。以下是具体的赔偿责任判断和处理方式：
故意或重大过失
如果员工故意给公司造成经济损失，用人单位有权要求其全额赔偿。
对于重大过失造成的损失，用人单位不能要求员工全额赔偿，而应根据员工的过失程度、工资收入等因素，部分赔偿。
一般过失
如果员工因一般过失给公司造成经济损失，通常无需承担赔偿责任。
劳动合同约定
根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。
公司规章制度
用人单位在规章制度中可以对员工因工作失误造成的损失进行规定，包括赔偿的范围、方式、限额等，但这些规定必须符合法律法规的要求，不能侵犯职工的合法权益。
赔偿方式与限额
经济损失的赔偿可以从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。
若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
实际损失与因果关系
用人单位要求劳动者赔偿损失时，应当提供证据证明自身遭受的实际损失，以及该损失与员工过错的因果关系。
其他考虑因素
在确定赔偿金额时，还需考虑员工的经济状况和工资收入，对于收入较低者，应当适当降低赔偿数额，以保证劳动报酬和岗位风险的对等性。
综上所述，员工造成公司损失时，赔偿责任的确定需要根据具体情况进行综合判断，既要考虑员工的过错程度，也要考虑公司的规章制度和实际损失情况，同时要保障劳动者的基本生活需要。