印章档案销毁程序可以参照以下步骤进行：
填写申请表
填写《印章销毁申请表》（见附件5），并由总经理审核批准后，持该申请表和待销毁的印章交办公室登记备案。
登记备案
办公室在接收印章销毁申请表后，应声明作废并定期销毁，同时填写《销毁印章登记表》（见附件6）。
检查档案
档案管理员定期检查档案过期状况，拟定销毁档案清册，经档案室负责人审核签字后提交鉴定小组。
鉴定档案
鉴定小组成员依据拟销毁档案清单鉴定过期档案，并撰写鉴定报告。
审批销毁
档案管理主管将销毁档案清册报局审批，审批是否通过，通过则进入下一步，不通过则返回第1步。
实施销毁
销毁档案时，应指定2人以上相关单位人员监督销毁过程，确保销毁过程安全、规范，并填写销毁记录。
存档备查
销毁完成后，将销毁档案清单及批文存档，以便后续监管和评估。
此外，还可以采取以下辅助措施：
可以邀请原在销毁印章的现场人员签字，并撰写销毁证明。
如果条件允许，可以重新刻一枚印章，再进行一次销毁，并再次撰写销毁证明。
这些步骤和措施应确保印章销毁过程的合法性、安全性和可追溯性。