平行发包和总承包在建筑工程中是比较常见的合同形式，它们有以下主要区别：
合同结构
平行发包：业主将工程项目的不同部分或专业工程分别发包给多个承包人，并与各个承包人签订合同。各承包人之间没有合同关系，他们直接与业主进行合同结算。
总承包：业主将工程项目的全部设计和施工任务发包给一个总承包商，由总承包商负责项目的总体管理和协调。总承包商再将其中的部分工作发包给其他分包商，但总承包商对整个工程的质量、进度、造价等全面负责。
管理责任
平行发包：业主需要分别与各个承包人进行合同谈判、签约和管理，工作量较大，但业主在开工前就可以明确整个工程的总造价，有利于早期控制。
总承包：业主只需与总承包商进行合同谈判和签约，后续的施工管理、协调工作由总承包商负责，业主的工作量相对较小，但一旦总承包商出现问题，可能会影响整个工程。
风险控制
平行发包：由于工程被拆分为多个部分，由多个分包商承包，风险较为分散，但业主需要分别管理各个分包商，协调难度较大，监理成本较高。
总承包：总承包商需要承担工程全过程的风险，市场竞争性较低，一旦总承包商出现问题，整个工程的风险将会更高。
进度控制
平行发包：各部分工程的招标和施工可以并行进行，有助于缩短建设周期。
总承包：通常需要等施工图设计全部结束后才能进行施工，进度相对较迟，建设周期较长。
质量控制
平行发包：质量控制较为分散，各分包商的质量控制由业主或监理分别负责。
总承包：质量控制由总承包商统一负责，业主的质量控制工作相对较少，但一旦总承包商选择不当，可能影响整个工程质量。
合同界面
平行发包：由于存在多个合同，合同界面较多，需要特别注意各合同之间的定义和协调，否则可能影响工程质量。
总承包：合同界面相对较少，总承包商需要负责所有合同的管理和协调。
建议：
平行发包适用于建设周期紧迫、需要分散风险的项目，但需要业主具备较强的协调能力和较高的监理成本。
总承包适用于建设周期较长、需要统一管理和协调的项目，但业主需要选择有经验和信誉的总承包商以降低风险。