在数控机床中，两个主轴的编程可以通过以下步骤进行：
确定加工对象和加工要求
明确需要加工的工件及其加工要求，包括尺寸、形状、表面精度等。
选择合适的机床
根据加工对象的要求，选择具有双主轴功能的机床。双主轴加工中心通常可以同时进行不同的切削操作。
编写加工程序
根据加工要求，使用CAD/CAM软件或手动编写双主轴编程程序。程序需要控制两个主轴的同步和非同步运动，以及它们之间的配合加工。
设定工件坐标系
在编写加工程序之前，确定工件坐标系。通常选择一个主轴为基准，其他主轴的坐标系根据其位置与基准主轴的关系确定。
设置刀具和切削参数
根据加工对象的特点，选择合适的刀具，并设置切削参数，包括切削速度、进给速度、切削深度等。每个主轴都需要设置相应的切削参数。
确定程序坐标系统
在编写加工程序时，确定程序坐标系统。通常选择相对于工件坐标系的刀具参考点进行编程，以方便程序的调试和修改。
运行加工程序
将编写好的加工程序加载到机床的数控系统中，并执行程序。在加工过程中，监控加工状态，及时调整切削参数以获得满意的加工结果。
检查加工质量
在加工完成后，对加工件进行检查，验证加工质量是否达到要求。如有需要，可以进行修磨或其他加工工序来改善加工质量。
常用编程指令
M指令：
M3/M4：启动主轴，M3表示正转，M4表示反转。
M41/M42：切换主轴焦点，M41切换到主轴1，M42切换到主轴2。
S指令：
Sxxx：设置主轴转速，xxx为具体的转速值。
F指令：
Fxxx：设置主轴进给，xxx为具体的进给速度值。
示例程序
```gcode
； 启动主轴1和主轴2
M3
M4
； 设置主轴1转速为1000转/分钟
S1000
； 设置主轴1进给速度为100毫米/分钟
F100
； 设置主轴2转速为1200转/分钟
S1200
； 设置主轴2进给速度为150毫米/分钟
F150
； 加工路径1
G01 X100 Y50
G01 Z-10
； 加工路径2
G01 X200 Y100
G01 Z-20
； 切换主轴焦点到主轴2
M42
； 加工路径3
G01 X150 Y75
G01 Z-15
； 切换主轴焦点到主轴1
M41
； 加工路径4
G01 X100 Y100
G01 Z-25
； 停止主轴1和主轴2
M4
M5
```
在这个示例中，程序首先启动两个主轴，并分别设置它们的转速和进给速度。然后，程序执行两个主轴的加工路径，并在加工过程中切换主轴焦点。最后，程序停止两个主轴。
通过以上步骤和示例程序，可以实现数控机床两个主轴的编程和控制。实际编程时，需要根据具体的加工需求和机床特性进行调整和优化。