财政预算工作程序主要包括以下四个阶段：
编制阶段
在新预算年度开始之前，预算管理部门确定财政支出总额，并按部门确定最初的分配方案。
各支出部门（职能部门）对最初方案提出反馈意见后，预算管理部门与各支出部门之间经过几个来回的修改与反馈，形成最终的预算草案，进入审批程序。
审批阶段
立法机关首先审定总体预算规模，再由专门的委员会对预算草案逐项审查并提出审查意见。
经立法机关批准后，预算草案成为正式财政预算，并成为具有法律效力的文件。
执行阶段
各收入机关依法及时、足额地完成财政收入计划。
预算管理部门根据预算对政府所属的职能部门拨款，各职能部门根据拨款履行其相应的政府职能。
决算阶段
预算年度结束之后，各职能部门和预算单位对执行结果进行总结，编制决算。
决算经预算管理部门汇总后，交立法机关审计和审批。
此外，部门预算的编制实行“两上两下”的程序，具体包括：
每年定期由财政向各部门布置预算编制工作，各部门在规定时间内上报部门收支预算建议计划。
财政主管部门将部门预算建议计划分送各业务部门进行初审，业务部门审定后报主管部门统一编制部门预算。
财政部门将汇总后的分预算科目、分部门的预算报主管政府综合平衡，预算经政府平衡后下达各部门。
各部门在规定时间内将调整后的预算计划报财政部门，财政将汇总的预算建议计划报政府、党委审定，形成的政府预算草案提交人代会审议，经人大批准后，财政再批复下达到各部门。
这些程序确保了财政预算的编制、审批、执行和决算过程的规范性和透明度，增强了预算的约束力和执行力。