大股东回购股权的程序主要包括以下几个步骤：
协商一致
股东和公司就股权回购事项协商达成一致。
履行协议义务
当事人按照协议约定履行义务。
修改公司记载
公司修改相关记载，办理股权变更登记。
诉讼回购
如果不能达成股权收购协议，可以向人民法院提起诉讼。
有限责任公司股权回购的具体程序
董事会决议
召开董事会并发布董事会决议公告，确定股票回购的目的、数量、比例、价格、方式、资金来源、期限等。
非关联董事和非关联监事发布关于公司股票回购的独立意见报告。
股东大会批准
董事会发布召开股东大会的公告。
召开股东大会审议董事会决议，由非关联股东对股票回购进行独立表决。
发布股东大会决议。
发布股票回购的独立财务顾问报告。
通知债权人
如果回购本公司股票后要注销，从而减少注册资本，自董事会决议发布之日起十日内通知债权人，并于三十日内在指定报纸或其它媒体上至少公告三次。
协议回购
有限责任公司召开股东会所讨论的事项如果涉及到法定事项中的任何一项以上的，在股东会通知书上就应当告知股东，如对表决结果存有异议的，可以行使股权回购请求权，在股东会决议通过后六十天内异议股东同公司协议回购股权，协商成功的双方签订书面协议，由公司按照合理的价格收购股权。
诉讼程序
异议股东就股权回购与公司达不成协议的，可以直接起诉公司要求公司买回股权，根据新公司法规定，股东可以自股东会会议决议通过之日起九十日内向人民法院提起诉讼。
上市公司股权回购的程序
决议
上市公司依照法律和公司章程的规定作出有效的股份回购决议。
协商与协议
与股东协商订立股份回购协议。
支付与变更登记
按照协议内容支付价款，履行义务。
办理变更登记。
注意事项
股东行使权利必须在规定的60日或者90日开展，否则权利过期。
必须存在股东会决议。
公司的控股股东滥用股东权利，严重损害公司或者其他股东利益的，其他股东有权请求公司按照合理的价格收购其股权。
这些程序确保了股权回购的合法性和透明度，保护了股东和公司的权益。建议在实施股权回购前，充分了解相关法律法规，并严格按照程序进行操作。