单位辞退员工的合法程序通常包括以下几个步骤：
明确解除理由
企业应根据《劳动合同法》的相关规定，明确解除劳动合同的理由。这些理由可能包括员工严重违反规章制度、不能胜任工作、严重失职等。
企业需要收集相应的证据来支持其决定，例如《规章制度签收确认函》、《员工处罚通知书》、《培训记录表》等。
通知工会
如果企业设有工会，那么在作出开除决定前，应事先将理由通知工会。工会有权提出意见或建议，企业应当认真考虑工会的意见。
书面通知员工
在确定解除理由并征得工会同意（如有）后，企业应向员工发出单方解除劳动合同的书面通知书。这份通知书是企业开除员工的关键法律文件，其内容必须准确、完整、合法。
与员工沟通
在通知员工后，企业应安排与员工进行沟通，听取员工的意见和诉求。双方可以就解除劳动合同的具体事项进行协商，如经济补偿、工作交接等。
办理离职手续
在双方达成一致后，企业应协助员工办理离职手续，包括结算工资、缴纳社保、转移档案等。
企业还需要向员工出具解除劳动合同的证明，并办理相关登记手续。
履行其他相关程序
企业还需要与员工进行工作交接，确保相关的工作资料和财务在规定的时间内交接清楚。
企业需要按照法律规定支付经济补偿，并在办结工作交接时支付。
保存证据
企业应保留所有与解除劳动合同相关的证据，包括书面通知、员工签收记录、工作交接记录等，以备将来可能出现的法律纠纷。
通过以上步骤，企业可以确保辞退员工的程序合法合规，避免因程序不当而产生法律风险。