内部审计的实施程序主要包括以下几个阶段：
准备阶段
编制审计方案：内部审计人员应在考虑组织风险、管理需要及审计资源的基础上，在审计项目实施前编制审计方案，对审计工作做出合理安排。审计方案一般由审计项目负责人编制，报内部审计机构负责人批准后施行。
发出审计通知书：在实施具体审计项目之前，内部审计机构应事先向被审计单位送达审计通知书，通知被审计单位审计时间、审计目标、审计范围以及被审计单位应当事先准备的资料等事项。
实施阶段
测试内部控制：内部审计人员应深入调查、了解被审计单位的情况，对其经营管理活动及内部控制的适当性和有效性进行测试。内部审计人员应根据审计方案的要求，对被审计单位内部控制全部或部分要素分别进行调查、研究，并测试其运行状况，对其适当性和有效性做出评价。
收集和分析证据：审计人员应收集各种证据并分析、评估和判断审计对象的内部控制和风险管理等情况。审计人员可以用检查、观察、询问、盘点、监盘、计算、分析性复核等方法实施审计，及在了解内部控制状况的基础上进行符合性测试和实质性测试，通过规范方法获得必要的证据材料。
报告阶段
编制审计报告：审计终结后，审计部应在规定时间内出具审计报告。审计报告要经审计部成员集体讨论，审计部成员均须在审计报告上签字认可，同时按有关规定征求被审计单位或个人的意见。
提交和审批：审计报告经审计部成员签字后，报送本单位领导审批。重要的审计报告还应同时报送同级国家审计机关。
后续阶段
执行审计决定：对被审计单位提出的改进建议，内部审计机构应跟踪其执行情况，确保问题得到妥善解决。
后续审计：对重大审计事项作出的处理决定，须报经本单位领导批准。经批准的处理决定，被审计单位必须执行。被审计单位对处理决定如有异议，可以接到处理决定之日起一定期限内提出书面申诉。
这些程序确保了内部审计的全面性、准确性和有效性，有助于企业及时发现和纠正问题，提高运营效率和风险管理水平。