工会监查调查程序主要包括以下几个步骤：
确定调查目的和范围
工会根据职工合法权益受侵害的情况，确定调查的目的和范围，以确保调查的有效性和针对性。
选择调查方式
工会可以采用多种方式进行调查，包括询问有关人员、实地调查取证等，以掌握企业或事业单位侵犯职工合法权益的起因、过程及造成的后果。
实施调查
工会进行实地调查，获取第一手材料，确保事实清楚、证据充分。企业或事业单位应予以协助，提供必要的方便条件，不得故意设置障碍。
记录调查结果
工会对调查过程中获取的信息进行详细记录，包括询问内容、实地调查结果等，以便后续分析和处理。
分析调查结果
工会对收集到的信息和证据进行分析，确定是否存在侵犯职工合法权益的行为，以及行为的性质和严重程度。
提出处理意见
工会根据调查结果，依法提出处理意见，要求企业或事业单位立即停止侵权行为，并采取补救措施，保护职工的合法权益。
监督执行
工会对处理意见的执行情况进行监督，确保企业或事业单位按照要求采取相应措施，防止侵权行为再次发生。
反馈和报告
工会将调查结果和处理情况向职工代表大会或全体职工报告，接受职工的监督和评议，并向相关部门反馈处理结果，以便进一步改进和监督。
通过以上程序，工会能够有效地维护职工的合法权益，促进企业或事业单位的合法合规运营。