开除院长的立案程序通常涉及以下步骤：
提交立案材料：
首先，需要向有关部门提交关于开除院长的相关材料和证据。这些材料可能包括书面报告、证人证言、相关文件等。
审核材料：
提交材料后，相关部门将对提交的材料进行审核，以确定是否存在需要立案的事项。
决定是否立案：
如果审核结果显示存在需要追责的情况，相关部门将按照各自的管辖范围进行立案侦查。如果不符合立案条件，将告知当事人补充资料或告知不符合立案的原因。
立案登记：
对于符合立案条件的事项，相关部门将受理案件并进行登记，出具收据、诉讼费通知书、地址确认书及案件受理通知书等文件。
缴纳费用：
当事人在规定的时间内需要缴纳相关费用和换取票据。如果未按时缴费，可能会导致案件被裁定撤诉。
案件处理：
立案后，相关部门将开始调查和处理案件，根据调查结果作出相应的处理决定。
需要注意的是，具体的立案程序可能因地区和具体情况而有所不同。建议在具体操作前咨询当地相关部门或法律专业人士，以确保按照正确的程序进行立案。