开除员工的程序主要包括以下几个关键步骤：
明确解除理由
根据《劳动合同法》的相关规定，明确解除劳动合同的理由，如员工严重违反规章制度、不能胜任工作、严重失职等。
收集相应的证据来支持其决定，例如《规章制度签收确认函》、《员工处罚通知书》和《培训记录表》等。
通知工会
如果企业设有工会，应在作出开除决定前，将理由通知工会。
工会有权提出意见或建议，企业应当认真考虑工会的意见。
书面通知员工
在确定解除理由并征得工会同意（如有）后，企业应向员工发出单方解除劳动合同的书面通知书。
这份通知书是企业开除员工的关键法律文件，其内容必须准确、完整、合法。
经济补偿金的计算
根据《劳动合同法》的规定，计算经济补偿金的基数为劳动合同解除之日前十二个月正常总收入的平均数。
如果劳动者月工资高于用人单位所在地区上年度职工月平均工资的三倍，经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付。
工作交接
由员工办结其工作交接，包括交还工具设备、办理结算工资福利和其他未了事宜等。
出具解除或终止劳动合同的证明
由单位向员工出具解除或者终止劳动合同的证明，并注明劳动合同的期限、解除或者终止的日期、工作岗位、在本单位的工作年限等信息。
转移档案和社保
按员工的要求转移员工的档案和社保。单位需要在法定时间内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。
确保合法性和程序正当性
认定员工严重违纪，必须依据合法有效的规章制度，并且规章制度必须经过民主程序制定，不违反国家法律法规，并已向员工公示或告知。
必须有证据证明劳动者严重违反规章制度，并且在劳动争议中用人单位举出充分的证据。
准备充分，有理有据
在开除员工前，确保所有决定都是基于客观事实和具体证据，准备好书面记录和同事的见证等。
预见并应对可能的问题
想办法减轻员工失落感，提供职业发展建议或推荐信，帮助他们找到新的机会。
通过以上步骤，企业可以确保开除员工的程序合法、合规，并最大程度地减少潜在的法律风险。