问题线索谈话程序主要包括以下几个步骤：
拟订谈话函询方案和相关工作预案
针对收到的问题线索，纪检机关需要拟订详细的谈话函询方案和相关工作预案，并按程序报批。
报批程序
对需要谈话函询的下一级党委（党组）主要负责人，应当报纪检机关主要负责人批准，必要时还需向同级党委主要负责人报告。
确定谈话人员
谈话应当由纪检机关相关负责人或者承办部门主要负责人进行，也可以由被谈话人所在党委（党组）或者纪委（纪检组）主要负责人陪同；经批准，也可以委托被谈话人所在党委（党组）主要负责人进行。
谈话过程
谈话应当在具备安全保障条件的场所进行，并制作谈话笔录。谈话后，可视情况由被谈话人写出书面说明。
处理结果
根据不同情形作出相应处理，如反映不实或没有证据证明存在问题的，予以了结澄清。
记录和报告
谈话过程应当形成工作记录，并妥善保存备查。必要时，还需向上级报告谈话结果。
这些程序旨在确保谈话的严肃性、规范性和有效性，防止党员干部由小错酿成大错，小问题变成大问题。