工程报账的程序主要包括以下几个步骤：
提交工程款支付申请表
施工单位需向工程部提交《工程款支付申请表》，该表必须经施工单位项目经理签字并加盖印章。
核实工程完成情况及质量
现场工程师核实本次请款的实际完成工程数量及工程质量，并签署《工程款支付申请表》。
工程部经理也需核实工程质量和数量并签署《工程款支付申请表》。
提交结算书及相关资料
工程完工后，施工单位需向预算专员提交电子版的结算书，并提供相应的设计变更、与工程造价相关的工作联系单、工程签证单等资料。
填写费用报销单及相关资料
经办人需填写费用报销单，并附上相关资料，如施工合同、发票、支付进度款单等。
内部审核流程
填写请款单或报销单时，需包括项目协议名称、请款内容、金额、付款形式及账户等信息。
工程部有关负责人签字、分管领导签字。
预算部审核签字，确认票据是否齐全、工程量是否属实、金额与协议规定的各阶段付款金额是否一致等。
财务部审核签字，确认票据是否齐全、金额与协议规定的各阶段付款金额是否一致等。
付款
根据协议上提供的账户进行付款。初次付款需提供双方签订的工程承包协议复印件或供货协议，并附上相关单据如送货单、入库单等。
报账周期
项目上按规定的时间进行报账，一般按月或者按两个星期进行。
借款与报销
借款需填写《借款申请单》，注明借款事由、金额、支票或现金等，并由主管部门经理审核签字、财务经理复核、总经理审批。
报销时，需根据费用性质填写对应单据，注明附件张数，金额大小写须完全一致，不得涂改。
会计处理
分析经济业务涉及到的账户变化，确定记入账户的借方或贷方，并编制完整的会计分录。
审核与批准
所有票据必须核销，违反规定不得再次借支。逾期未还借支者转为个人借款从工资中扣回。
建议：
施工单位应确保所有报账材料的真实性和完整性，以便顺利通过内部审核。
财务部应严格按照公司规定的流程进行审核，确保资金支付的准确性和合规性。
项目经理和分管领导应加强对工程进度和质量的把控，以减少不必要的返工和费用。