划拨土地出让金的计算方法如下：
有实际成交价的
若成交价不低于所在级别基准地价平均标准，则土地出让金按成交价不低于40%的标准计算。
若成交价低于基准地价平均标准，则土地出让金按全部地价的40%计算。
发生转让的划拨土地使用权补办出让时
按基准地价平均标准的40%计算土地出让金。
有异议的
由受让人委托有资质的土地估价机构进行评估，按评估价的40%计算土地出让金。
划拨土地使用权成本价格占土地价格的最高比例不得高于60%
在以划拨土地使用权价格计算出让金时，必须将成本价格换算成市场土地价格，再按不低于40%的标准计算土地出让金。
建议
实际成交价与基准地价的关系：在计算土地出让金时，首先需要确定土地的成交价，并与所在级别的基准地价平均标准进行比较。如果成交价低于基准地价平均标准，则按照全部地价的40%计算；如果成交价不低于基准地价平均标准，则按照成交价不低于40%的标准计算。
异议处理：如果土地使用权受让人对计算结果有异议，可以委托有资质的土地估价机构进行评估，并按照评估价的40%计算土地出让金。
成本价格换算：在计算土地出让金时，若划拨土地使用权成本价格占土地价格的比例超过60%，则需要将成本价格换算成市场土地价格，再按照不低于40%的标准计算土地出让金。
这些计算方法确保了土地出让金的计算既公平又合理，同时也保障了土地使用权受让人和国家的利益。