环境影响评价报告的收费标准主要依据国家计委和国家环境保护总局发布的《关于规范环境影响咨询收费有关问题的通知》（计价格 125号）。具体的收费方式如下：
按估算投资额分档定额计费
估算投资额在3000万元以下的项目，编制环境影响报告书的费用为5-6万元。
估算投资额在3000万元至2亿元的项目，编制环境影响报告书的费用为6-15万元。
估算投资额在2亿元至10亿元的项目，编制环境影响报告书的费用为15-35万元。
估算投资额在10亿元至50亿元的项目，编制环境影响报告书的费用为35-75万元。
估算投资额在50亿元至100亿元的项目，编制环境影响报告书的费用为75-110万元。
估算投资额在100亿元以上的项目，编制环境影响报告书的费用为110万元以上。
按咨询服务工日计费
如果按估算投资额分档定额计费不便于计费，可以参照工日费用标准由工程咨询机构与委托方议定，但参照工日计算的收费额不得超过按估算投资额分档计费方式计算的收费额。
其他费用
评估环境影响报告书（含大纲），每增加一个专题加收50%。
遥测、风洞实验、污染气象规划、地探、物探、卫星图片解读、需要动用船、飞机等特殊检测等费用需另行计算。
地区性调整
各环境影响评价机构对估算投资额100亿元以下的农业、林业、渔业、水利、建材、市政（不含垃圾及危险废物集中处置）、房地产、仓储（涉及有毒、有害及危险品的除外）、烟草、邮电、广播电视、电子配件组装、社会事业与服务建设项目的环境影响评价收费，应在原国家计委、国家环保总局规定的收费标准基础上下调20%收取。
其他注意事项
收费中不包括获取相关经济、社会、水文、气象、环境现状等基础数据的费用。
收费标准应遵循公平、公正、合理和透明的原则，具体收费标准应依据不同的评价内容、评价难度和工作量进行调整。
建议在实际操作中，环境影响评价机构与委托方应根据具体项目的性质、规模和复杂程度，在规定的基准价基础上，结合当地实际情况进行协商确定，并确保收费标准的透明和合理。