环境保护费的费率计算公式为：
环境保护费费率 = 本项费用年度平均支出 ÷ （全年建安产值 × 直接工程费占总造价比例）
具体到不同类型的工程，环境保护费的费率有所不同。例如：
建筑工程的环境保护费费率分别为0.45%、0.4%、0.35%、0.3%
市政工程的环境保护费费率分别为0.4%、0.35%、0.3%、0.25%
安装工程的环境保护费费率分别为2.0%、1.5%、1.0%
装饰工程的环境保护费费率分别为1.8%、1.3%、0.8%
此外，环境保护费的计算基数通常包括分部分项工程量清单、定额人工费、单价措施项目清单、定额人工费等 。
建议根据具体工程类型和当地政策，参考上述费率进行计算。