程序违法行为的处理方式主要依据违法的性质、严重程度以及相关法律规定。以下是一些常见的处理方式：
行政处罚
责令改正：有权机关在发现程序违法时，可责令违法者改正其违法行为。
行政处分：对直接负责的主管人员和其他直接责任人员，依法给予行政处分。
行政处罚决定无效：不遵守法定程序的行政处罚决定是无效的。
行政许可撤销
撤销行政许可：对违反法定程序作出准予行政许可决定的，可撤销该行政许可。
行政强制措施
责令改正：有权机关违反法定程序实施行政强制，可责令改正，并给予相关人员行政处分。
行政复议
撤销或变更行政行为：行政相对人可申请行政复议，行政复议机关可撤销或变更违反法定程序的行政行为。
重新作出具体行政行为：在决定撤销或确认具体行政行为违法时，可责令被申请人在一定期限内重新作出具体行政行为。
人民法院判决
撤销或部分撤销：法院可判决撤销或部分撤销违反法定程序的行政处罚，并要求被告重新作出具体行政行为。
发回重审：法院在审理过程中发现程序违法，可发回原审法院重审。
内部处理
法官程序违法：法官在审判阶段出现程序性违法行为，通常会受到内部处罚，如警告、记过等。
招标和投标
责令改正：招标人或招标代理机构违反程序，有关行政监督部门可责令其改正，严重者可能导致招标无效并重新招标。
交通技术监控设备记录
协助调查：处理地公安机关交通管理部门可协助违法行为发生地公安机关交通管理部门调查违法事实，并代为履行处罚告知程序。
建议
在处理程序违法行为时，应首先明确违法行为的性质和相关法律规定，然后选择合适的处理方式。对于较为严重的违法行为，如行政处罚或行政许可撤销，应及时采取纠正措施，并确保对相关责任人员进行适当处分。同时，应加强内部监督，防止程序违法行为的发生。