工程资料填写程序可以按照以下步骤进行：
开工前准备工作
进行图纸会审。
提交施工组织设计、开工报告、设计变更单等必要文件，并确保这些资料得到甲方和监理单位的签字盖章。
开始记录施工日志，以便后续补充。
材料进场
对进场材料、配件、设备进行验收，记录验收记录。
填写见证取样送检书，并进行出厂质量证明书及现场抽样检验。
确保每批主材、设备及主要辅材都进行进场报验，并记录厂家资质证明、合格证上的数量、采购员姓名等信息。
分部分项施工与检验批
填写单位工程名称、施工项目名称、施工部位等信息。
根据实际情况填写各类规范和对应专业的内容，并确保施工单位的评定结果为“符合要求”。
系统测试
记录水管道严密性、系统隐蔽工程、冷凝水灌水试验、风管漏光检测试验等实际试验数据。
竣工调试与试运转验收
进行系统联合试运转记录、设备运行调试、工程观感记录、分部分项验收记录、单位工程验收记录，并填写实际试验数据。
施工档案资料整理
及时、准确、真实地填写档案记录，确保签证齐全、字迹清晰，使用签字笔填写，避免使用铅笔或圆珠笔。
使用省建设工程质量监督总结统一印制的表格，将各种试验单、合格证分类装订并登记，填写汇总表。
最后，将所有资料整理归档，形成一份完整的竣工资料。
这些步骤应确保工程资料的真实性、完整性和及时性，以便于工程验收和后续管理。建议在实际操作中，根据具体工程情况和当地要求，对上述步骤进行适当调整。