当行政执法程序出现漏洞时，可以采取以下措施进行处理：
督促补正
对于情节轻微且未对相对人权利产生实际影响的程序违法行为，行政执法监督机关应督促相关部门对案件程序进行补正。
内部纠错
充分发挥行政系统内部纠错纠偏作用，对内部审批程序也进行监督。
告知义务履行
如果存在先处罚后告知或告知内容不完整（包括告知事项不明和告知的权利不充分）的情况，应视为行政机关未依法履行告知义务。这种情况下，行政处罚决定可能无效，行政相对人可以不执行，并且行政机关申请法院执行时，法院可能会不予受理或裁定不予执行。
撤销原决定并重新履行调查程序
对于程序错误的行政处罚，应当撤销原决定，并重新履行调查程序和作出新的决定。撤销原决定需由负责人召集集体讨论决策，不能由低于原来决策机构层级的机构来撤销。
重新作出决定
调查取证结束后，行政机关应依照行政处罚的相关法律法规规定，依法决策后作出新决定。如果撤销原处罚决定仅仅因为适用法律错误等不需调查取证、改变原认定事实的情形，新决定可与撤销原决定的决定一并作出。
主动纠正违法行为
行政机关如果发现相应的行政处罚错误，应当主动纠正自己的违法行为，重新启动对事件的调查及相应的法律适用，并对已经造成损失的行政处罚进行撤销或赔偿。
行政复议和行政诉讼
当事人对于行政执法程序违法的，可以申请行政复议，经审查确实程序违法的，会撤销行政执法案件。相关法律规定了行政复议的申请和适用情况。
通过以上措施，可以有效处理行政执法程序漏洞，确保行政行为的合法性和公正性。