孙姓的来源主要有以下几种：
起源于姬姓
卫康叔的后代：孙姓最早来源于春秋时期的姬姓卫国，为周文王之子卫康叔的后代。卫康叔的八世孙姬和因攻灭西戎有功，被周平王赐为公爵，史称卫武公。卫武公的儿子惠孙，惠孙的孙子名乙，字武仲，以祖父的字为氏，成为孙姓的始祖。
起源于芈姓
孙叔敖的后代：春秋楚国令尹孙叔敖，其庶子孙以祖字为姓，称为孙叔氏，后来去掉叔字改为孙姓。
起源于妫姓
孙书的后代：孙书是春秋时齐景公赐姓孙的齐国大夫，因伐莒有功，景公赐姓孙氏，食采于乐安，成为乐安孙氏的始祖。
起源于子姓
比干的后代：商朝末年，朝臣比干因为受到纣王的杀害，其子孙为了躲避祸患，纷纷改姓，其中有一部分就改了孙姓。
赐姓和改姓
荀姓改姓：汉代因避汉宣帝讳，荀姓子孙改为孙。
夏侯姓改姓：据《汉书·夏侯婴传》，夏侯婴的曾孙颇尚主，主随外家姓，号孙公主，故滕公子孙更为孙氏。
其他改姓：如三国时东吴将领俞河因功被赐姓孙，明初朱元璋禁胡姓，胡姓多为二字复姓，不得不省字而改孙姓等。
少数民族改姓
汉化改姓：在今满族、景颇族、苗族、阿昌族、哈尼族、土家族、黎族、傣族、佤族等少数民族中，均有孙氏族人分布，其来源大多是在唐、宋、元、明、清时期中央政府推行的羁糜政策及改土归流运动中，流改为汉姓孙氏。
综上所述，孙姓是一个多民族、多源流的姓氏，主要源自姬姓、芈姓、妫姓及改姓等，最早可追溯到3000多年前的周文王时期。