个体工商户和个人独资企业在税收方面的主要区别如下：
所得税
个体工商户：只需缴纳个人所得税。经营所得以每一纳税年度的收入总额减除成本、费用以及损失后的余额为应纳税所得额，适用5%至35%的超额累进税率缴纳个人所得税。
个人独资企业：同样只需缴纳个人所得税。其投资、生产和经营所得比照个体工商户征收个人所得税。
增值税
个体工商户：通常作为小规模纳税人，按3%的征收率申报纳税。在某些情况下，个体工商户可以享受增值税优惠政策，例如“六税两费”减免政策。
个人独资企业：一般不涉及企业所得税，但可能需要缴纳增值税。个人独资企业出租住房时，应按适用税率或征收率计算缴纳增值税。
管理费
个体工商户：除依法纳税外，还必须向工商行政管理机关缴纳一定比例的管理费。
个人独资企业：不需缴纳管理费。
法律地位和分支机构设立
个体工商户：不采用企业形式，一般认为属于个人。不能设立分支机构。
个人独资企业：属于企业组织形态，可以设立分支机构，有助于企业扩大经营规模及占有市场占有率。
其他税种
个体工商户：通常只需缴纳个人所得税和可能的其他小税种。
个人独资企业：可能需要缴纳更多的税种，如增值税、企业所得税等，具体税率和优惠政策根据地区和具体情况而定。
建议：
选择合适的经营形式时，应综合考虑税务成本、税收优惠、管理费用、法律地位及分支机构设立等因素。
具体税收政策可能因地区和时间而异，建议在实际操作中咨询当地税务机关或专业税务顾问，以获取最新和准确的税收信息。