宝马主机编程序的软件有以下几种：
ISTA+ （Integrated Service Technical Application）:
官方的诊断和编程软件，用于诊断和编程宝马系列车辆的各种电子模块。
功能强大，可以读取车辆故障码、编程ECU、配置和校准部件等。
ISTA-P （Integrated Service Technical Application – Programming）:
官方的编程软件，用于对车辆的ECU进行编程操作。
支持对各种控制模块进行编程，包括引擎控制模块、传动系统、底盘控制模块、仪表盘等。
BMW Coding Tool:
第三方的编程工具，可以与ISTA-P配合使用，提供更多的编程选项和功能。
适合进行定制化的设置。
E-Sys:
宝马编程开发工具，主要用于编写和修改宝马车辆的软件代码。
可以编程车辆的各个模块，例如音频、导航和驱动等。
INPA （Integrated Network Vehicle Communication Interface）:
宝马车辆的诊断软件，用于读取和清除故障码、进行实时数据监测和调整车辆参数。
通常与其他宝马诊断软件配合使用，如NCS Expert和WinKFP。
NCS Expert （New Car Software Development Expert）:
宝马车辆编程工具，主要用于修改和编程车辆的控制单元参数。
可以对车辆进行个性化设置、更改功能选项、激活隐藏功能等。
WinKFP （WinKey Free Programming）:
用于编程ECU的软件，可以通过连接车辆的OBD II接口来进行编程操作。
Tool32:
命令行工具软件，提供了更高级的控制和调试功能，可以帮助工程师进行更深入的ECU编程工作。
建议：
如果你是宝马车主或维修技师，建议首先使用宝马官方的ISTA+和ISTA-P软件，因为它们是官方认可的工具，功能全面且稳定。
如果你需要一些定制化的设置或更高级的编程功能，可以考虑使用BMW Coding Tool和NCS Expert。
确保使用的软件版本与你的宝马车型相匹配，并且定期更新软件以获取最新的功能和安全补丁。