适用陪审制的程序主要包括 第一审刑事、民事和行政案件。具体来说：
第一审程序：
陪审制度仅适用于人民法院受理的第一审案件，包括刑事、民事和行政案件。
合议庭组成：
在第一审案件中，合议庭可以由审判员和陪审员共同组成，或者仅由审判员组成，但合议庭的成员人数必须是单数。
案件类型：
涉及群体利益、公共利益、人民群众广泛关注的案件，以及社会影响较大的第一审案件，可以适用陪审制。
当事人申请：
在刑事案件中，被告人可以申请由人民陪审员参加合议庭审判；在民事案件中，当事人也有权申请人民陪审员参与审理。
二审和再审：
陪审制度不适用于二审及再审程序。
综上所述，适用陪审制的程序主要是针对第一审的刑事、民事和行政案件，且需要符合一定的案件类型和条件。